En langsgående havnetunnel fra Strandvænget i nord til Amagermotorvejen ved Sjællandsbroen i syd kan udformes på mange forskellige måder, både med hensyn til størrelse (2, 4 eller 6 spor), til placering i havneløbet og ikke mindst med hensyn til antallet og placeringen af vejtilslutningerne undervejs.

Der er i de indledende undersøgelser fokuseret på flere varianter af havnetunnelen. Varianterne har til fælles, at de er 4-sporede, og at der i nord er tilslutningsanlæg ved Strandvænget, i Nordhavn og ved Refshaleøen. I syd er der tilslutning til Amagermotorvejen ved trekantanlægget syd for Sjællandsbroen.

De fem varianter

Varianterne af havnetunnelen beskrives primært i forhold til deres funktion i forbindelse med vejbetjening af byudviklingsområderne i Sydhavnen og langs Øresundskysten (Nordhavn og Refshaleøen mv.), herunder den trafikbelastning som tilslutningsanlæggene forventes at få. Desuden beskrives deres funktion i forbindelse med aflastning af Indre By for gadetrafik mv.

Det er ligeledes forudsat, at der gennemføres en omfattende trafiksanering af gadenettet i Indre By, således at den gennemkørende trafik i vid udstrækning henvises til den nye havnetunnel. Den forudsatte trafiksanering omfatter bl.a. udvidelser af gågadenettet, sammenhængende cykelstinet, vejlukninger, krydsombygninger og hastighedsnedsættelser i Indre By. Etableringen af et P-anlæg i tilknytning til havnetunnelen indgår dog ikke i forudsætningerne for beregningerne.

Den kollektive trafik er forudsat udbygget kraftigt med metrolinier både i de tætte bydele – som beskrevet i "Udredning om Cityringen" fra Transport- og Energiministeriet i maj 2005 – og i de nye byudviklingsområder. Det indebærer, at der i trafikberegningerne også er forudsat metrolinier fra Hovedbanegården via Sydhavnen til Ny Ellebjerg Station, fra Østerport Station til Nordhavnsområdet og fra Østerport Station under havnen via Refshaleøen til stationen ved Øresundsvej (station på metrolinien til Lufthavnen). Busbetjeningen er forudsat tilpasset de nye metrolinier som beskrevet i udredningen om Cityringen. Den forudsatte høje standard for den kollektive trafikbetjening skal sikre, at der også i beregningerne af fremtidens trafik vil være en jævn fordeling på hovedtransportmidlerne cykel, bil og kollektiv trafik.